CODE_DIR=$(shell pwd)/..

include MakeRules

CPPFLAGS = $(OptCPPFLAGS)

ifdef AT_NCBI

CPPFLAGS += -Werror

ALL= \

ascii \

assignment \

colors_test \

connectPairs \

count \

curl_easy_test \

dir_size \

effectiveSize \

extractPairs \

file2hash \

graph_test \

gzip_test \

index_find \

key_test \

list2pairs \

mergePairs \

min_spanning_forest \

multilist2subset \

numeric_test \

objHash_find \

random_words \

replace_dict \

setMinus \

setRandOrd \

speed_test \

splitList \

str2hash \

trav

ifdef AT_NCBI

all: $(ALL) \

ncurses_key_test

else

all: $(ALL)

ascii.o: $(COMMON_HPP)

asciiOBJS=ascii.o $(CPP_DIR)/common.o

ascii: $(asciiOBJS)

$(CXX) -o $@ $(asciiOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

assignment.o: $(COMMON_HPP) $(CPP_DIR)/graph.hpp $(CPP_DIR)/numeric.hpp $(CPP_DIR)/bipartite.hpp

assignmentOBJS=assignment.o $(CPP_DIR)/common.o $(CPP_DIR)/graph.o $(CPP_DIR)/numeric.o $(CPP_DIR)/bipartite.o

assignment: $(assignmentOBJS)

$(CXX) -o $@ $(assignmentOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

colors_test.o: $(COMMON_HPP)

colors_testOBJS=colors_test.o $(CPP_DIR)/common.o

colors_test: $(colors_testOBJS)

$(CXX) -o $@ $(colors_testOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

connectPairs.o: $(COMMON_HPP)

connectPairsOBJS=connectPairs.o $(CPP_DIR)/common.o

connectPairs: $(connectPairsOBJS)

$(CXX) -o $@ $(connectPairsOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

count.o: $(CPP_DIR)/numeric.hpp $(COMMON_HPP)

countOBJS=count.o $(NUMERIC_OBJ)

count: $(countOBJS)

$(CXX) -o $@ $(countOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

cpp_test.o: $(COMMON_HPP)

cpp_testOBJS=cpp_test.o $(SEQ_OBJ)

# $(CPP_DIR)/common.o

cpp_test: $(cpp_testOBJS)

$(CXX) -o $@ $(cpp_testOBJS) $(LIBS)

# -lncursesw -lz

$(ECHO)

curl_easy_test.o: $(COMMON_HPP) $(CPP_DIR)/curl_easy.hpp

curl_easy_testOBJS=curl_easy_test.o $(CPP_DIR)/common.o $(CPP_DIR)/curl_easy.o

curl_easy_test: $(curl_easy_testOBJS)

$(CXX) -o $@ $(curl_easy_testOBJS) $(LIBS) -lcurl

$(ECHO)

dir_size.o: $(COMMON_HPP)

dir_sizeOBJS=dir_size.o $(CPP_DIR)/common.o

dir_size: $(dir_sizeOBJS)

$(CXX) -o $@ $(dir_sizeOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

effectiveSize.o: $(COMMON_HPP)

effectiveSizeOBJS=effectiveSize.o $(CPP_DIR)/common.o

effectiveSize: $(effectiveSizeOBJS)

$(CXX) -o $@ $(effectiveSizeOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

extractPairs.o: $(COMMON_HPP)

extractPairsOBJS=extractPairs.o $(CPP_DIR)/common.o

extractPairs: $(extractPairsOBJS)

$(CXX) -o $@ $(extractPairsOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

file2hash.o: $(COMMON_HPP)

file2hashOBJS=file2hash.o $(CPP_DIR)/common.o

file2hash: $(file2hashOBJS)

$(CXX) -o $@ $(file2hashOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

fstream_test.o: $(COMMON_HPP)

fstream_testOBJS=fstream_test.o $(CPP_DIR)/common.o

fstream_test: $(fstream_testOBJS)

$(CXX) -o $@ $(fstream_testOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

graph_test.o: $(COMMON_HPP) $(CPP_DIR)/graph.hpp

graph_testOBJS=graph_test.o $(CPP_DIR)/common.o $(CPP_DIR)/graph.o

graph_test: $(graph_testOBJS)

$(CXX) -o $@ $(graph_testOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

gzip_test.o: $(COMMON_HPP) $(CPP_DIR)/gzip.hpp

gzip_testOBJS=gzip_test.o $(CPP_DIR)/common.o $(CPP_DIR)/gzip.o

gzip_test: $(gzip_testOBJS)

$(CXX) -o $@ $(gzip_testOBJS) $(LIBS) -lz

$(ECHO)

index_find.o: $(COMMON_HPP)

index_findOBJS=index_find.o $(CPP_DIR)/common.o

index_find: $(index_findOBJS)

$(CXX) -o $@ $(index_findOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

key_test.o: $(COMMON_HPP)

key_testOBJS=key_test.o $(CPP_DIR)/common.o

key_test: $(key_testOBJS)

$(CXX) -o $@ $(key_testOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

list2pairs.o: $(COMMON_HPP)

list2pairsOBJS=list2pairs.o $(CPP_DIR)/common.o

list2pairs: $(list2pairsOBJS)

$(CXX) -o $@ $(list2pairsOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

mergePairs.o: $(COMMON_HPP)

mergePairsOBJS=mergePairs.o $(CPP_DIR)/common.o

mergePairs: $(mergePairsOBJS)

$(CXX) -o $@ $(mergePairsOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

min_spanning_forest.o: $(COMMON_HPP) $(CPP_DIR)/graph.hpp

min_spanning_forestOBJS=min_spanning_forest.o $(CPP_DIR)/common.o $(CPP_DIR)/graph.o

min_spanning_forest: $(min_spanning_forestOBJS)

$(CXX) -o $@ $(min_spanning_forestOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

multilist2subset.o: $(COMMON_HPP)

multilist2subsetOBJS=multilist2subset.o $(CPP_DIR)/common.o

multilist2subset: $(multilist2subsetOBJS)

$(CXX) -o $@ $(multilist2subsetOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

ncurses_key_test.o: $(COMMON_HPP) $(CPP_DIR)/ncurses.hpp

ncurses_key_testOBJS=ncurses_key_test.o $(CPP_DIR)/common.o $(CPP_DIR)/ncurses.o

ncurses_key_test: $(ncurses_key_testOBJS)

$(CXX) -o $@ $(ncurses_key_testOBJS) $(LIBS) -lncursesw

$(ECHO)

numeric_test.o: $(COMMON_HPP) $(CPP_DIR)/numeric.hpp

numeric_testOBJS=numeric_test.o $(NUMERIC_OBJ)

numeric_test: $(numeric_testOBJS)

$(CXX) -o $@ $(numeric_testOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

objHash_find.o: $(COMMON_HPP)

objHash_findOBJS=objHash_find.o $(CPP_DIR)/common.o

objHash_find: $(objHash_findOBJS)

$(CXX) -o $@ $(objHash_findOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

random_words.o: $(COMMON_HPP)

random_wordsOBJS=random_words.o $(CPP_DIR)/common.o

random_words: $(random_wordsOBJS)

$(CXX) -o $@ $(random_wordsOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

replace_dict.o: $(COMMON_HPP)

replace_dictOBJS=replace_dict.o $(CPP_DIR)/common.o

replace_dict: $(replace_dictOBJS)

$(CXX) -o $@ $(replace_dictOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

setMinus.o: $(COMMON_HPP)

setMinusOBJS=setMinus.o $(CPP_DIR)/common.o

setMinus: $(setMinusOBJS)

$(CXX) -o $@ $(setMinusOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

setRandOrd.o: $(COMMON_HPP)

setRandOrdOBJS=setRandOrd.o $(CPP_DIR)/common.o

setRandOrd: $(setRandOrdOBJS)

$(CXX) -o $@ $(setRandOrdOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

speed_testOBJS=speed_test.o

speed_test: $(speed_testOBJS)

$(CXX) -o $@ $(speed_testOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

splitList.o: $(COMMON_HPP)

splitListOBJS=splitList.o $(CPP_DIR)/common.o

splitList: $(splitListOBJS)

$(CXX) -o $@ $(splitListOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

str2hash.o: $(COMMON_HPP)

str2hashOBJS=str2hash.o $(CPP_DIR)/common.o

str2hash: $(str2hashOBJS)

$(CXX) -o $@ $(str2hashOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)

trav.o: $(COMMON_HPP)

travOBJS=trav.o $(CPP_DIR)/common.o

trav: $(travOBJS)

$(CXX) -o $@ $(travOBJS) $(LIBS)

$(ECHO)